Tomando como punto de partida los años 1600-1639, es de anotar que por los años 1600 ya en esta región como en muchas de Colombia, existían primitivos pobladores; esta región fue habitada por colonos pertenecientes a tribus indígenas como la Mocanà, Chimilas y con marcado tiempo, por los negros cimarrones; siendo esta circunstancia una razón válida para afirmar que la fecha 19 de Diciembre de 1639 es una fecha referencial, ya que en esta, se aúnan las voluntades del Cabildo de Cartagena, la del Virrey SEBASTIAN DE ESLAVA , la del notario de la época y sumado a estas, la petición hecha por DonBALTAZAR ORTEGA y Doña TOMASA DEL CAMPO, para entregar al capitán DIEGO DE REVOLLEDO, el titulo de 8 a 9 caballerías de tierras, que fueron de propiedad del sacerdote JOSE MARIA DEL CASTILLO, bajo escritura número 21 que es fiel copia de la número 19.
Toda esta región se llamó MAHABANA, que en lengua Mocanà, significa “REPOSO DE PESCADORES”; de ahí, el primer nombre de esta población.
En el año de 1610, por disposición de la Realeza Española, se le da el nombre de SAN LUIS BELTRAN, dada la devoción a este sacerdote misionero, quien realizo una loable labor evangelizadora, razón por la cual, fue declarado su patrono desde entonces. Después a consecuencia de la captura de un mamífero acuático llamado Manatí, en una de las ciénagas que desde entonces lleva su nombre la cual ha sido disecada (Ciénaga de Manatí), se le dio el último y definitivo nombre: Manatí, que hace parte de los Municipios que conforman el Departamento del ATLÁNTICO.
La población de Manatí, fue elevada a la categoría de Municipio el 23 de Octubre de 1855, mediante la ordenanza número 11, emanada de la HONORABLE ASAMBLEA del Departamento de BOLIVAR, dado que esta región perteneció a este, siendo su primer Alcalde el señor AVELINO CASTAÑO.
En el año de 1874 al Municipio de Manatí, se le dio la categoría de parroquia, integrando a los Municipios de Repelón, Candelaria y Campo de la Cruz; su primer párroco fue AGUSTIN JOSE CHARRIS.
En el año de de 1903 se inicio la construcción del templo siendo sacerdotes entonces, JULIO VASQUEZ SALGADO, quien comando esta gesta, mas tarde la comunidad y el reverendo BACILIO NATERA, construyeron el frente.
En 1917 se le paso también a la categoría de Notaria, su primer notario fue el señor ANIBAL VIZCAINO.
Teniendo en cuenta que son muchísimos los datos que nutren la historia de este Municipio, tratamos de recopilar los mas sobresalientes, entre ellos tenemos:
- La Alcaldía funcionó, en sus primeros tiempos en varias partes, es decir, en algunas habitaciones de la población, luego paso al lugar que hoy ocupa; su primera remodelación en parte, tuvo lugar en el año de 1963, en la administración del señor LUCAS SANJUAN ZARATE y su reconstrucción dados los acontecimientos en el año 2000, se inicio en el año 2005 y fue inaugurada el 23 de Octubre del año 2006 por parte del señor Alcalde YAMIL CABARCAS ROMERO.
- La construcción de la primera escuela, el señor DOMINGO CASTAÑO donó el terreno donde se construyo esta y su primer profesor fue el señorMIGUEL CAICEDO.
- La primera profesora titulada fue la señora MARIA SIMMOS DE RODRIGUEZ. Los señores PORFIRIO CASTILLO y SEBASTIAN ALCALA, lo fueron en el año de 1928 y a ellos se les debe también debido a su espíritu progresista, la construcción del matadero, el mercado y el actual cementerio, ya que el primero estaba ubicado en lo que es hoy, parte del barrio el mercado.
- El primer registrador de Instrumentos Públicos en Manatí, fue el señor JOSE OLIVERO CASTAÑO.
- El primer telegrafista fue el señor ALBERTO GONZALEZ.
- El doctor MATEO NAJERA OLIVERO fue el primer medico que tuvo la población, egresado de la universidad de Paris.
- El primer abogado fue el doctor SEBASTIAN ALCALA quien fue presidente de la Cámara de Representantes y también Senador de la republica.
Otro aspecto histórico cultural es el referente a las escuelas: es importante mencionar que en los comienzos no hubo escuelas públicas, existían las escuelas privadas las cuales funcionaban en las casas de quienes ejercían la función de profesor. Entre ellas podemos citar las siguientes:
- La escuela de la niña INES ZARATE DE CASTILLO
- La escuela del señor ANGEL PEREIRA
- La escuela de la niña ARIZA
- La escuela de la niña PACHECO.
Funcionaban como Escuelas de segunda Enseñanza las siguientes:
- El instituto Sucre de Don CLAUDIO GUERRERO, en el año de 1926 y fueron sus primeros maestros, MANUEL ALCALA, LACIDEZ SANJUAN, CALIXTO NAJERA ZARATE y WENCESLAO BRAVOI.
- Colegio la Inmaculada Concepción para señoritas, fundado por el sacerdote LUIS GABRIEL GALAN, fueron sus primeros profesores la señoraSOCORRO NAJERA SANJUAN, CALIXTO NAJERA ZARATE y CLAUDIO GUERRERO.
Como consecuencia del avance generalizado es de importancia histórica conocer también, los aspectos y particularidades de cada una de las escuelas y colegios y sus respectivas sedes de básica primaria, las cuales aparecen en la Reseña Histórica Educativa de Municipio.